Bioinformatika Docking: Contoh Studi Senyawa Aktif dalam Piper aduncum terhadap Protein Tubulin
Bioinformatika muncul atas desakan kebutuhan untuk mengumpulkan, menyimpan dan menganalisa data-data biologis dari database DNA, RNA maupun protein. Keberadaan database adalah syarat utama dalam analisis bioinformatika. Database protein dapat ditemukan di Swiss-Prot (Swiss) untuk sekuen asam aminonya dan di Protein Data Bank (PDB) (AS) untuk struktur 3D-nya (Sussman dkk., 1998).
Docking merupakan salah satu cakupan dari bioinformatika, terutama untuk tujuan penemuan obat (Utama, 2003). Docking merupakan suatu teknik penelitian untuk memprediksikan apakah suatu molekul dapat berikatan dengan reseptor. Protein, DNA, dan ligan docking diprediksikan dengan teknik penempatan pada area tertentu. Protein dan ligan dibuat secara modelling dan dicari interaksi ikatan sehingga perilaku ligan sebagai inhibitor ataupun agonis dapat diketahui.
Laporan lebih lengkap bisa di download disini
